内気な小学４年生“桂木わかば”は運命に導かれる様に魔女と出会い、損な性格の自分を少しでも変えたくて魔女修行を始めます。その修行を通じて、たくさんのかけがえのないものを手に入れ成長していく。
魔女見習い試験１級に合格するも、魔女への道は遠く険しい。修行はまだまだ続く。お話もまだまだ続く。そんなわかば達も元に身元不明の赤ん坊が転がり込んで来る。わかば達はその子の母親代りを始めるが…。しかもその赤ちゃん、かなり大変は病気で…。はたしてわかば達幼き母は、その赤ちゃんを救う事ができるのか！。そしてさらに悪夢とも戦うぞっ。
虹宮の魔法堂が星の海を巡るツアーを展開し、人間達に魔法界の一端を紹介していきます。その傍ら、星の海に消えたわかばを捜して、かぐら達の冒険も始まる。かぐらはわかばを見つける事ができるのか、そしてわかばは…。さらに、星の海に眠る財宝をめぐっての抗争に巻き込まれて行く。
カグヤ姫の伝説に憧れ、地球に行く事を夢見る、月の女王候補“かぐら”は、ついにその夢に向かって動き出します。まずかぐらが向かったのは…。「おジャ魔女わかば(無印)」のサイドストーリー
まだバットカードが世に散らばっている時代。バットカードを集めながら修行に励む少女ひなたの魔女物語。
常に凛々しく生きる事を心がける少女りんく。でも凛々しいって大変。そんな時に街は魔法による事件で大騒ぎに…。
u4の描く、その後の“どれみ”。魔法を頼ることなく告白する勇気を手に入れたどれみは、中学に入り…。はづきは矢田との微妙な関係に悩む。ももこはアメリカで順調なパテェシェ修行を始めていた。